Dziurkacz i igła są zanurzone w płynie odkażającym. Przed podniesieniem stempla i igły niewielka ilość płynu odkażającego jest wciągana przez próżnię pomiędzy stempel i igłę, a następnie suszona.
Dezynfekcja UV
Można zastosować stację dezynfekcji UV, która jednocześnie zdezynfekuje całą tacę jaj przed wejściem do stacji zaszczepiania.